Het Mosteiro de Santa Cruz heeft geleden van mensenhanden die er voortdurend aan verbouwd hebben.
Het is een van de meest historische gebouwen van Portugal; de twee eerste koningen van Portugal liggen hier begraven en Camôes en Antonius van Padua hebben hier gestudeerd. De genoemde verbouwingen hebben er voor gezorgd dat het niet meer een van de mooiste monumenten der Manuelstijl is. Die zijn te zien in Batalha, Tomar en Lissabon.
Toch is het Claustro do Silencio, de kruisgang, nog een prachtig voorbeeld van die stijl en zijn daar de Renaissancefontein en de reliëfs, die het passieverhaal uitbeelden (naar gravures van Albrecht Dürer!) zeer de moeite waard.
Grote kunstenaars hebben hier gewerkt: Boytaca natuurlijk, de meester van de Manuelstijl, de Fransman Nicolas de Chanterène, de kunstenaar die behalve het hoofdportaal en de preekstoel ook de rijk versierde koningsgraven schiep, en Jean de Rouen, de kunstenaar uit Rouaan, die de grappige tweede kruisgang aanlegde en wellicht de koorstoelen sneed, talhawerk, dat de avonturen van Vasco da Gama uitbeeldt.